一般共聚焦顯微鏡專用物鏡的焦距都很短,只有10倍物鏡的焦距可以直接透過96孔板的底部看到細胞。如果你想用更高倍數的物鏡觀察,必須使用特殊的96孔板,或者特殊的長工作距離物鏡。我見別人用過一種底部是0.17mm厚度玻璃的96孔板,這個可以向幾個細胞培養耗材生產商問問,長工作距離的物鏡可以向共聚焦顯微鏡的生產商問,一般這個就比較貴了。
挑選到滿意的sgRNA之后,就要開始正式實驗,而正式實驗中細胞轉染部分我則不會再講,直接到最關鍵的部分:挑取單克隆。
(1)Day 0: 質粒轉染
還是同之前一樣,將sgRNA-pSpCas9質粒轉入到目的細胞中,此時根據可根據細胞不同,選用不同的轉染試劑或轉染方法。
(2)Day 2/3: 篩選
根據使用的Cas9骨架質粒的不同,篩選的方式也不同:
在這里我選擇方法(2)
(3)挑取單克隆
篩選過后的細胞則按照1個/孔的密度種到96孔板中,放在Incucyte之類活細胞工作站監控,每天拍2-3張全孔掃描照片,7天后查看96孔板單克隆生長狀況,反查第1天時的照片,確認是單細胞即可。以下是Incucyte的結果示例(因為連續視頻有點大,因此放上day1和day10的圖):
(4)Day 10(根據不同的細胞,選擇不同培養時間)
將挑中的單克隆消化后接種到24孔板中擴大培養等待后續驗證。
(5)沒有可全孔掃描拍照的儀器怎么辦
Incucyte是挑單克隆的利器,可全孔掃描的儀器也可使用,由于可以追蹤到最早期的細胞個數,因此能確認細胞克隆是來自于單細胞。但Incucyte之類的儀器并不是所有平臺都有,此時只能用老方法進行單克隆細胞挑?。?/p>
試過之后,覺得方法(3)容易實現一些,可如下圖所示:
對于轉染難度低且皮實的細胞來說,挑取單克隆可以說是在我這個CRISPR-Cas9敲除方案中最難的一個實驗,非常之關鍵。
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