微生物能以各種有機物質作為原料，能分解很多廢棄物質。水污染中，利用微生物作用可以凈化水資源。環境中，微生物可降解各種不易處理的垃圾等。還有很多，如很難處理的海上石油泄漏，也可以用超級細菌進行處理，微生物作用很多也很復雜。
第一：微生物的個體微小，容易培養；第二：微生物繁殖快；第三：微生物治污具有針對性
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