無環境污染，特異性強，作用范圍廣，效果明顯
制藥廢水通常屬于較難處理的高濃度有機污水之一, 因藥物產品不同、生產工藝不同而差異較大, 其特點是組成復雜, 有機污染物種類多、濃度高, CODCr 值和BOD5 值高且波動性大, 廢水的BOD5 / CODCr 值差異較大, NH3-N 濃度高, 色度深, 毒性大, 固體懸浮物SS 濃度高。而且制藥廠通常是采用間歇生產, 產品的種類變化較大, 造成了廢水的水質、水量及污染物的種類變化較大。制藥工業廢水主要包括抗生素生產廢水、合成藥物生產廢水、中成藥生產廢水以及各類制劑生產過程的洗滌水和沖洗廢水四大類。
近幾年來, 我國各類醫藥化工及保健品制造業迅猛發展, 而在制藥過程中排放的大量有毒有害廢水嚴重危害著人們的健康。尋求工藝合理, 運行穩定, 維護管理方便, 能最大限度地體現社會、經濟、環境效益的工藝技術, 是亟待研究的方向和思路。
合成制藥的廢水主要要考慮兩類廢水的預處理 母液（高鹽、高有機物）、含溶劑廢水。母液一般是采用蒸餾、溶劑廢水主要回收溶劑。而且合成制藥廢水可生化性低需要預處理。
發酵制藥的廢水可生化高 主要是含油含有機溶劑廢水的預處理；當然要考慮到菌渣的去除。